15 000 años en el futuro, Union entra en su tercera era. El Tercer Comité trabaja ahora para abordar los fallos y crímenes de sus predecesores, saliendo de Cradle y sus mundos centrales hacia la galaxia a la que su revolución aún no ha llegado. Lancer presenta un escenario profundo y rico en historia con el que los jugadores pueden interactuar si así lo desean. Cada elección que hacen, cada sistema que montan, cada arma que empuñan... todo ello tiene una historia detrás, a la espera de que se desarrolle.